Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mesp2O08574 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mesp2O08574 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mesp2O08574 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mesp2O08574 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mesp2O08574 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms