Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U90926O08546 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U90926O08546 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U90926O08546 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U90926O08546 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U90926O08546 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U90926O08546 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U90926O08546 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U90926O08546 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U90926O08546 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U90926O08546 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U90926O08546 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
U90926O08546 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
U90926O08546 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U90926O08546 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U90926O08546 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
U90926O08546 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
U90926O08546 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
U90926O08546 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
U90926O08546 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
U90926O08546 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U90926O08546 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
U90926O08546 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
U90926O08546 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U90926O08546 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U90926O08546 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
U90926O08546 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U90926O08546 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
U90926O08546 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U90926O08546 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U90926O08546 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U90926O08546 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U90926O08546 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U90926O08546 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U90926O08546 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U90926O08546 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U90926O08546 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U90926O08546 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U90926O08546 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U90926O08546 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U90926O08546 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U90926O08546 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U90926O08546 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U90926O08546 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U90926O08546 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U90926O08546 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U90926O08546 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U90926O08546 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U90926O08546 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U90926O08546 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U90926O08546 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U90926O08546 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U90926O08546 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U90926O08546 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U90926O08546 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U90926O08546 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U90926O08546 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U90926O08546 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U90926O08546 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U90926O08546 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U90926O08546 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U90926O08546 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U90926O08546 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U90926O08546 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U90926O08546 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U90926O08546 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U90926O08546 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U90926O08546 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U90926O08546 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U90926O08546 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U90926O08546 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U90926O08546 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U90926O08546 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
U90926O08546 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
U90926O08546 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U90926O08546 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
U90926O08546 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
U90926O08546 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
U90926O08546 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U90926O08546 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U90926O08546 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U90926O08546 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U90926O08546 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
U90926O08546 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
U90926O08546 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U90926O08546 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U90926O08546 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U90926O08546 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
U90926O08546 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U90926O08546 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U90926O08546 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U90926O08546 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms