Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PIK3C2AO00443 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PIK3C2AO00443 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PIK3C2AO00443 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIK3C2AO00443 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PIK3C2AO00443 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIK3C2AO00443 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIK3C2AO00443 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PIK3C2AO00443 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
PIK3C2AO00443 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PIK3C2AO00443 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PIK3C2AO00443 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIK3C2AO00443 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PIK3C2AO00443 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PIK3C2AO00443 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms