Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF4O00268 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF4O00268 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF4O00268 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF4O00268 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF4O00268 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF4O00268 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF4O00268 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4O00268 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF4O00268 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4O00268 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4O00268 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF4O00268 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4O00268 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4O00268 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4O00268 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4O00268 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4O00268 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF4O00268 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4O00268 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4O00268 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4O00268 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4O00268 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF4O00268 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4O00268 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4O00268 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4O00268 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF4O00268 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF4O00268 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4O00268 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4O00268 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4O00268 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4O00268 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF4O00268 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4O00268 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4O00268 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4O00268 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF4O00268 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4O00268 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4O00268 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4O00268 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF4O00268 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4O00268 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4O00268 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF4O00268 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4O00268 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4O00268 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4O00268 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4O00268 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF4O00268 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4O00268 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF4O00268 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4O00268 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4O00268 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF4O00268 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF4O00268 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4O00268 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4O00268 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF4O00268 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF4O00268 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF4O00268 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4O00268 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4O00268 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF4O00268 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4O00268 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4O00268 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF4O00268 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF4O00268 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF4O00268 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4O00268 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF4O00268 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF4O00268 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF4O00268 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF4O00268 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF4O00268 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4O00268 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4O00268 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF4O00268 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF4O00268 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF4O00268 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF4O00268 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF4O00268 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF4O00268 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF4O00268 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF4O00268 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF4O00268 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF4O00268 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF4O00268 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF4O00268 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF4O00268 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF4O00268 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF4O00268 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF4O00268 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF4O00268 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF4O00268 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF4O00268 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF4O00268 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF4O00268 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF4O00268 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF4O00268 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms