Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NFKBIEO00221 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NFKBIEO00221 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NFKBIEO00221 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NFKBIEO00221 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NFKBIEO00221 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NFKBIEO00221 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFKBIEO00221 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms