Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGPSO00116 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGPSO00116 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGPSO00116 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGPSO00116 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGPSO00116 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGPSO00116 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGPSO00116 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGPSO00116 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGPSO00116 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGPSO00116 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGPSO00116 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGPSO00116 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGPSO00116 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGPSO00116 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGPSO00116 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGPSO00116 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGPSO00116 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGPSO00116 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGPSO00116 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGPSO00116 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGPSO00116 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGPSO00116 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGPSO00116 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGPSO00116 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGPSO00116 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGPSO00116 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGPSO00116 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGPSO00116 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGPSO00116 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGPSO00116 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGPSO00116 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGPSO00116 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGPSO00116 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AGPSO00116 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGPSO00116 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AGPSO00116 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGPSO00116 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGPSO00116 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGPSO00116 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGPSO00116 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGPSO00116 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGPSO00116 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AGPSO00116 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGPSO00116 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGPSO00116 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AGPSO00116 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGPSO00116 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGPSO00116 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGPSO00116 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGPSO00116 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGPSO00116 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGPSO00116 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGPSO00116 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGPSO00116 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGPSO00116 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGPSO00116 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGPSO00116 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGPSO00116 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGPSO00116 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGPSO00116 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGPSO00116 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGPSO00116 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGPSO00116 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGPSO00116 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGPSO00116 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGPSO00116 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGPSO00116 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGPSO00116 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGPSO00116 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGPSO00116 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGPSO00116 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGPSO00116 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGPSO00116 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGPSO00116 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGPSO00116 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGPSO00116 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGPSO00116 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGPSO00116 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGPSO00116 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGPSO00116 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGPSO00116 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGPSO00116 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGPSO00116 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGPSO00116 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGPSO00116 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGPSO00116 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGPSO00116 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGPSO00116 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGPSO00116 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGPSO00116 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGPSO00116 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGPSO00116 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms