Protein–RNA interactions for Protein: O00110

OVOL3, Putative transcription factor ovo-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OVOL3O00110 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OVOL3O00110 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OVOL3O00110 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OVOL3O00110 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
OVOL3O00110 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OVOL3O00110 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms