Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smim22J3QP37 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smim22J3QP37 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smim22J3QP37 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smim22J3QP37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smim22J3QP37 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smim22J3QP37 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smim22J3QP37 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smim22J3QP37 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smim22J3QP37 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smim22J3QP37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smim22J3QP37 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms