Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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