Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm28051J3QMA2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28051J3QMA2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28051J3QMA2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28051J3QMA2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28051J3QMA2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms