Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
I3L3M4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
I3L3M4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
I3L3M4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
I3L3M4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
I3L3M4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
I3L3M4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
I3L3M4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
I3L3M4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
I3L3M4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
I3L3M4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
I3L3M4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
I3L3M4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
I3L3M4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
I3L3M4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
I3L3M4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
I3L3M4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
I3L3M4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
I3L3M4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
I3L3M4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
I3L3M4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
I3L3M4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
I3L3M4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
I3L3M4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
I3L3M4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
I3L3M4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
I3L3M4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
I3L3M4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
I3L3M4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
I3L3M4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
I3L3M4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
I3L3M4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
I3L3M4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
I3L3M4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
I3L3M4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
I3L3M4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
I3L3M4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
I3L3M4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
I3L3M4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
I3L3M4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
I3L3M4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
I3L3M4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
I3L3M4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
I3L3M4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
I3L3M4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
I3L3M4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
I3L3M4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
I3L3M4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
I3L3M4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
I3L3M4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
I3L3M4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
I3L3M4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
I3L3M4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
I3L3M4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
I3L3M4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
I3L3M4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
I3L3M4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
I3L3M4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
I3L3M4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
I3L3M4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
I3L3M4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
I3L3M4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
I3L3M4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
I3L3M4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
I3L3M4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
I3L3M4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
I3L3M4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
I3L3M4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
I3L3M4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
I3L3M4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
I3L3M4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
I3L3M4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
I3L3M4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
I3L3M4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
I3L3M4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
I3L3M4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
I3L3M4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
I3L3M4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
I3L3M4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
I3L3M4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
I3L3M4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
I3L3M4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
I3L3M4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
I3L3M4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
I3L3M4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
I3L3M4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms