Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccl26F8VQM2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccl26F8VQM2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccl26F8VQM2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccl26F8VQM2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccl26F8VQM2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccl26F8VQM2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccl26F8VQM2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccl26F8VQM2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccl26F8VQM2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccl26F8VQM2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms