Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp9yF8VPU6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp9yF8VPU6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp9yF8VPU6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp9yF8VPU6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp9yF8VPU6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp9yF8VPU6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms