Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28048F7BCN0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28048F7BCN0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28048F7BCN0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm28048F7BCN0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28048F7BCN0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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