Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dcdc2bF7BCK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dcdc2bF7BCK0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dcdc2bF7BCK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Dcdc2bF7BCK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Dcdc2bF7BCK0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Dcdc2bF7BCK0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcdc2bF7BCK0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms