Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atf6F6VAN0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf6F6VAN0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf6F6VAN0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf6F6VAN0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf6F6VAN0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms