Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm10477F6SW83 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10477F6SW83 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10477F6SW83 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10477F6SW83 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm10477F6SW83 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm10477F6SW83 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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