Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc6F2Z461 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Herc6F2Z461 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc6F2Z461 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc6F2Z461 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Herc6F2Z461 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc6F2Z461 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc6F2Z461 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc6F2Z461 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc6F2Z461 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc6F2Z461 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms