Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd7E9Q9W7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdzd7E9Q9W7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdzd7E9Q9W7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdzd7E9Q9W7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdzd7E9Q9W7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdzd7E9Q9W7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdzd7E9Q9W7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms