Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc146E9Q9F7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc146E9Q9F7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc146E9Q9F7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc146E9Q9F7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc146E9Q9F7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc146E9Q9F7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc146E9Q9F7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc146E9Q9F7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.9 ms