Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc85cE9Q6B2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc85cE9Q6B2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc85cE9Q6B2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc85cE9Q6B2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc85cE9Q6B2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccdc85cE9Q6B2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms