Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DspE9Q557 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DspE9Q557 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DspE9Q557 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DspE9Q557 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DspE9Q557 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DspE9Q557 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DspE9Q557 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DspE9Q557 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DspE9Q557 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DspE9Q557 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DspE9Q557 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DspE9Q557 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DspE9Q557 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DspE9Q557 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DspE9Q557 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DspE9Q557 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DspE9Q557 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DspE9Q557 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DspE9Q557 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DspE9Q557 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DspE9Q557 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DspE9Q557 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DspE9Q557 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DspE9Q557 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DspE9Q557 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DspE9Q557 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DspE9Q557 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DspE9Q557 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms