Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpfE9Q3P4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpfE9Q3P4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpfE9Q3P4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpfE9Q3P4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CenpfE9Q3P4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpfE9Q3P4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms