Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Speer4f2E9Q366 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f2E9Q366 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f2E9Q366 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Speer4f2E9Q366 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4f2E9Q366 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4f2E9Q366 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms