Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ddx60E9PZQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ddx60E9PZQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ddx60E9PZQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddx60E9PZQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ddx60E9PZQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ddx60E9PZQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ddx60E9PZQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddx60E9PZQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms