Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PBE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PBE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PBE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PBE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PBE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E9PBE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E9PBE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E9PBE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E9PBE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
E9PBE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E9PBE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E9PBE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E9PBE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PBE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PBE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PBE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E9PBE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PBE3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E9PBE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PBE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PBE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PBE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PBE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PBE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PBE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PBE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PBE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PBE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PBE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PBE3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PBE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PBE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PBE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PBE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PBE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PBE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PBE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PBE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PBE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PBE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PBE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PBE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PBE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PBE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PBE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PBE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PBE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PBE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E9PBE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PBE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PBE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PBE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PBE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PBE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PBE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PBE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PBE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PBE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PBE3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PBE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PBE3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E9PBE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PBE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PBE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PBE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PBE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PBE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PBE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PBE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PBE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PBE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PBE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PBE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PBE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PBE3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PBE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PBE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PBE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PBE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PBE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PBE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PBE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PBE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PBE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PBE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PBE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PBE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PBE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E9PBE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E9PBE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PBE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms