Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRN3E7EW58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRN3E7EW58 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRN3E7EW58 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRN3E7EW58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRN3E7EW58 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms