Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb3D3Z6J4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb3D3Z6J4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb3D3Z6J4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb3D3Z6J4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms