Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930455H04RikD3Z622 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930455H04RikD3Z622 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930455H04RikD3Z622 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930455H04RikD3Z622 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930455H04RikD3Z622 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930455H04RikD3Z622 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms