Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4G5

Gm20499, Predicted gene 20499, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20499D3Z4G5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20499D3Z4G5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20499D3Z4G5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20499D3Z4G5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20499D3Z4G5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20499D3Z4G5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms