Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tgfbr3lD3YZZ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfbr3lD3YZZ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms