Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc6D3YZP9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc6D3YZP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc6D3YZP9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc6D3YZP9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc6D3YZP9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc6D3YZP9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc6D3YZP9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc6D3YZP9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc6D3YZP9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc6D3YZP9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc6D3YZP9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc6D3YZP9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc6D3YZP9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms