Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm4297D3YWB7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm4297D3YWB7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm4297D3YWB7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm4297D3YWB7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm4297D3YWB7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm4297D3YWB7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm4297D3YWB7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm4297D3YWB7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm4297D3YWB7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm4297D3YWB7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm4297D3YWB7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms