Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN25C9JDP6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN25C9JDP6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN25C9JDP6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN25C9JDP6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms