Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRBOX1C9JBD0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRBOX1C9JBD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRBOX1C9JBD0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRBOX1C9JBD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRBOX1C9JBD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms