Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Loxhd1C8YR32 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Loxhd1C8YR32 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Loxhd1C8YR32 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Loxhd1C8YR32 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Loxhd1C8YR32 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Loxhd1C8YR32 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms