Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptprz1B9EKR1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptprz1B9EKR1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptprz1B9EKR1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptprz1B9EKR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprz1B9EKR1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms