Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SHISA8B8ZZ34 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHISA8B8ZZ34 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA8B8ZZ34 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA8B8ZZ34 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA8B8ZZ34 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA8B8ZZ34 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA8B8ZZ34 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHISA8B8ZZ34 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms