Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20547B8JJN0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20547B8JJN0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20547B8JJN0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20547B8JJN0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20547B8JJN0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms