Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EIF3CLB5ME19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EIF3CLB5ME19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF3CLB5ME19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF3CLB5ME19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms