Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syce3B5KM66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syce3B5KM66 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syce3B5KM66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Syce3B5KM66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syce3B5KM66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syce3B5KM66 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms