Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF879B4DU55 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF879B4DU55 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF879B4DU55 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF879B4DU55 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms