Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700018F24RikB2RW27 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
1700018F24RikB2RW27 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
1700018F24RikB2RW27 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700018F24RikB2RW27 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700018F24RikB2RW27 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700018F24RikB2RW27 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
1700018F24RikB2RW27 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1700018F24RikB2RW27 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700018F24RikB2RW27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms