Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Brpf1B2RRD7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brpf1B2RRD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Brpf1B2RRD7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Brpf1B2RRD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brpf1B2RRD7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brpf1B2RRD7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms