Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOBPA7XYQ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOBPA7XYQ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOBPA7XYQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOBPA7XYQ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOBPA7XYQ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOBPA7XYQ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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