Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRIQ3A6PVS8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ3A6PVS8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ3A6PVS8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRIQ3A6PVS8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRIQ3A6PVS8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRIQ3A6PVS8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms