Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRRM3A6NNA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRRM3A6NNA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRRM3A6NNA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRRM3A6NNA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRRM3A6NNA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms