Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOL1A6NHN0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
OTOL1A6NHN0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
OTOL1A6NHN0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOL1A6NHN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOL1A6NHN0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOL1A6NHN0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOL1A6NHN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOL1A6NHN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOL1A6NHN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOL1A6NHN0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms