Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZNF316A6NFI3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
ZNF316A6NFI3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ZNF316A6NFI3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF316A6NFI3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ZNF316A6NFI3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.63■■■■□ 3.46
ZNF316A6NFI3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZNF316A6NFI3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms