Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA6L9A6NEM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6L9A6NEM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6L9A6NEM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms